近年来，学院承担国家重点研发计划、973计划、863计划、国家科技支撑计划、国际科技合作专项等国家级科研课题178项，其中国家自然基金项目144项，国家自然基金重点和国家优秀青年基金项目各1项，科研经费达2.9亿元。获国家科技进步二等奖2项、江西省自然科学一等奖等省部级一等奖6项、其他省部级科研成果奖14项；授权发明专利298项；发表论文1509篇，其中SCI论文746篇。ESI高被引论文27篇，占南昌大学高被引论文总篇数的44.26%。与雀巢、中粮、伊利、江中、煌上煌、阳光等知名企业开展合作，一批科研成果实现产业化，形成了理工农医渗透、产学研用结合的科研格局，成为国家和江西省专业技术、人才培养、科学研究和成果转化的重要基地，为助力江西经济社会发展和实现在中部地区崛起提供知识服务、智力支持和创新动力。